全程導(dǎo)醫(yī)網(wǎng) 健康焦點(diǎn)：中科院上海生命科學(xué)研究院計(jì)算生物學(xué)研究所徐書華研究組科研人員，新近采用一種搜尋人群特異拷貝數(shù)變異的新方法，檢測(cè)到一段藏族特異的拷貝數(shù)缺失區(qū)域，并通過群體遺傳學(xué)和生物信息學(xué)分析，推測(cè)該缺失區(qū)域可能是藏族適應(yīng)高原低氧環(huán)境的關(guān)鍵遺傳因素。該研究論文日前在線發(fā)表于最新一期《美國(guó)人類遺傳學(xué)雜志》上。專家認(rèn)為，該研究有助于解決困擾科學(xué)家多年的高原極端環(huán)境生物學(xué)適應(yīng)機(jī)制問題。
在研究中，徐書華等科研人員采用一種搜尋人群特異拷貝數(shù)變異的新方法，在DNA微陣列芯片的原始熒光信號(hào)中，檢測(cè)出一段藏族特異性缺失的約3400個(gè)核苷酸對(duì)的區(qū)域，同時(shí)通過多種實(shí)驗(yàn)技術(shù)和生物信息學(xué)分析技術(shù)，在2000多個(gè)世界范圍的人群樣本中，確認(rèn)了該段拷貝數(shù)缺失的發(fā)生幾率。
科研人員發(fā)現(xiàn)，該段拷貝數(shù)缺失的頻率在藏族人群中高達(dá)90%，其中純合缺失個(gè)體的頻率達(dá)到50%;而在2000多個(gè)其他人群的樣本中，其頻率只有3%，并且未發(fā)現(xiàn)攜帶純合缺失的個(gè)體。通過參考現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫和文獻(xiàn)進(jìn)行功能注釋分析，科研人員發(fā)現(xiàn)該缺失的序列上有組蛋白增強(qiáng)子的記號(hào)，并且與之前報(bào)道的血紅蛋白濃度相關(guān)聯(lián)的單核苷酸位點(diǎn)具有很強(qiáng)的連鎖效應(yīng)。
同時(shí)，科研人員通過對(duì)拷貝數(shù)缺失區(qū)域?qū)嵤╅L(zhǎng)程PCR和Sanger測(cè)序法，進(jìn)一步驗(yàn)證了這一缺失在藏族群體中存在頻率高，并確定了該缺失區(qū)域的斷點(diǎn)在基因組的精確位置。隨后，科研人員還對(duì)7個(gè)藏族人進(jìn)行了全基因組深度測(cè)序，并未發(fā)現(xiàn)除此之外的其他藏族特異的拷貝數(shù)變異。該研究的一系列發(fā)現(xiàn)和證據(jù)，都提示了該拷貝數(shù)缺失在藏族低氧適應(yīng)中可能具有重要功能意義。
據(jù)悉，參與該研究的單位還有中科院昆明動(dòng)物所、復(fù)旦大學(xué)、西藏民族學(xué)院、新疆醫(yī)科大學(xué)、馬來西亞UCSI大學(xué)、韓國(guó)加圖立大學(xué)等。
徐州導(dǎo)醫(yī)熱線：0516-85707122
